فیلوژنی مولکولی قبیله های boragineae و lithospermeae با تاکید بر سرده (boraginaceae s.str.) onosma بر اساس توالی های هسته ای nrdna its در ایران
thesis
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم
- author نسیم سعادتی
- adviser شاهرخ کاظم پور اصالو علی اصغر معصومی
- Number of pages: First 15 pages
- publication year 1390
abstract
تیره (subfamily boraginoideae=) boraginaceae s. str دارای 100 سرده و حدود 1600 گونه در دنیا با مرکز پراکنش در اوراسیا می باشد . در فلور ایران 36 سرده و 180 گونه از آن معرفی شده است . onosma l. با 150 گونه ، بزرگترین سرده در زیر تیره boraginoideae درقبیله lithospermeae قرار می گیرد. در این تحقیق 80 گونه مورد آنالیز قرار گرفت از جمله 3 گونه از echiochileae ، 14 گونه از قبیله boragineae و 32 گونه از قبیله lithospermeae ، 10 گونه از قیبله cynoglosseae و 15 گونه از قیبله erithrichieae به همراه سرده هایheliotropium bacciferum forssk. وtournefortioa rubicund salzm.ex dc به عنوان برون گروه در نظر گرفته شده اند همچنین در آنالیز جدا 59 گونه از سرده onosma بررسی شدند. نواحی nrdna its برای قبیله های boragineae و echiochileae همچنین lithospermeae با تاکید بر سرده onosma و trnh-psba برای گونه های onosma با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز به همراه پرایمرهای همگانی مربوطه تکثیر و توالی یابی گردید و به کمک برنامه muscle همردیف سازی شدند. بازسازی فیلوژنی با استفاده از مدل تکاملی gtr + i+gو روش بایسین،بیشینه پارسیمونی و بیشینه احتمال انجام گرفت.آنالیز تعیین زمان واگرایی سرده ها و گونه ها نیز توسط نرم افزار beast انجام گرفت. آنالیز داده های nr dna its نشان می دهد زیرتیره boraginoideaeدر ایران به 4 قبیله echiochileae, boragineae, lithospermeae, cynoglosseae s.l تقسیم می شود. در این میان قبیله های lithospermaea و boragineae کلاد های خواهری تشکیل می-دهند، echiochileae کلاد پایه ای در زیرخانواده boraginoideae است. قبیله های lithospermeae و echiochileae با حمایت بالا تک تبارند و boragineae با خروج suchtelenia تک تبار می باشد. سردهkar.ex meisner. suchteleniaدر این تحقیق با توجه به آنالیز cpdna trnl-f و nrdna its باa. dc. heterocaryum از cynoglosseae s.l. مترادف شد. گونه onosma orientalis) (syn podonosma orientalis شاخه خواهری کلاد alkanna است.onosma در ایران تک تبار نمی باشد، به طوری که گونه-های آن در 3 کلاد جداگانه قرار می گیرند.زیربخشه های onosma و asterotricha تک تبار نبوده بنابراین صفت کرک در تقسیم بندی onosma مصنوعی است.onosma rostellata از بخشه protonosma با گونه های شرق آسیا کلاد مستقلی را تشکیل می دهند. با توجه به نتایج نرم افزار beast زمان واگرایی زیرخانواده boraginoideae حدود 54 میلیون سال قبل و زمان واگرایی سرده onosmaاز echium دوران الیگوسن(33 میلیون سال قبل) تخمین زده شد. با مقایسه توالی های dna بارکد، گونه های مترادف شده(.rech.f) moltkia gypsacea با گونه (willd.) lehm. moltkia coeruleae و(ghahr&attar) onosma iranshahrii با(boiss & buhse) onosam bilabiata هرکدام گونه ای مستقل در نظر گرفته شدند.
similar resources
فیلوژنی مولکولی قبیله های boragineae و lithospermeaeبا تاکید بر سرده onosma (boraginaceae s. str.) براساس توالی های هسته ای nrdna its در ایران
تیره (subfamily boraginoideae=) boraginaceae s. str دارای 100 سرده و حدود 1600 گونه در دنیا با مرکز پراکنش در اوراسیا می باشد . در فلور ایران 36 سرده و 180 گونه از آن معرفی شده است . onosma l. با 150 گونه ، بزرگترین سرده در زیر تیره boraginoideae درقبیله lithospermeae قرار می گیرد. در این تحقیق 80 گونه مورد آنالیز قرار گرفت از جمله 3 گونه از echiochileae ، 14 گونه از قبیله boragineae و 32 گونه ...
فیلوژنی مولکولی جنس ( Rochelia (Boraginaceae بر اساس توالی های nrDNA ITS و cpDNA trnL-F
تعداد 8 گونه از جنس Rochelia و دو گونه از Lappula (به عنوان برون گروه) با استفاده از توالی هستهای ITS و توالی کلروپلاستی trnL-F به طور جداگانه و نیز به صورت ترکیبی آنالیز شدند. برای مشخص کردن روند تکامل صفات مورفولوژیکی، شش صفت تشخیصی بر روی درخت ترکیبی با استفاده از برنامه MacClade 4 نشان داده شد. آنالیز ها آشکار کرد که بخشه Rochelia به دلیل قرار گرفتن بخشه مونوتیپیک Cryptocarpa (Rochelia c...
full textفیلوژنی مولکولی سرده hedysarum بر اساس توالی nrdna its
چکیده سرده hedysarum با دارا بودن حدود 200 گونه از اعضای اصلی قبیله hedysarea به شمار می رود که در مناطق معتدله تا قطبی نیمکره شمالی پراکنش یافته است. مرکز اصلی گونه زایی این سرده در آسیای مرکزی و شمال آمریکا می باشد. به دلیل وجود هموپلازی فراوان در صفات ریخت شناسی این سرده تا کنون بسیاری از طبقه بندی های انجام شده برای این سرده مصنوعی بوده است. به همین دلیل مطالعه این رده براساس داده های مول...
15 صفحه اولفیلوژنی مولکولی قبیله hedysareae با تأکید ویژه بر جنس onobrychis بر اساس توالی های nrdna its
تعداد 53 گونه (54 توالی) شامل 28 گونه از قبیله hedysareae، 5 گونه از کلاد vicioid و 19 گونه از قبیله galegeae از جمله دو گونه glycyrrhiza به عنوان برون گروه با استفاده از توالی های nrdna its در آنالیز فیلوژنی با روش بیشینه صرفه جویی قرار گرفت. آنالیز براساس وزن دهی مجدد پی درپی با شاخص سازگاری تصحیح شده فاش نمود که کلاد vicioid اولین شاخه ای است که بدنبال آن کلاد chesneya-caragana و کلاد astrag...
full textفیلوژنی مولکولی قبیله Hedysareae با تأکید ویژه بر جنس Onobrychis بر اساس توالیهای nrDNA ITS
تعداد 53 گونه (54 توالی) شامل 28 گونه از قبیله Hedysareae، 5 گونه از کلاد Vicioid و 19 گونه از قبیله Galegeae از جمله دو گونه Glycyrrhiza به عنوان برونگروه با استفاده از توالیهای nrDNA ITS در آنالیز فیلوژنی با روش بیشینه صرفهجویی قرار گرفت. آنالیز براساس وزندهی مجدد پیدرپی با شاخص سازگاری تصحیح شده فاش نمود که کلاد Vicioid اولین شاخهای است که بدنبال آن کلاد Chesneya-Caragana و کلاد Astrag...
full textفیلوژنی مولکولی جنس ( rochelia (boraginaceae بر اساس توالی های nrdna its و cpdna trnl-f
تعداد 8 گونه از جنس rochelia و دو گونه از lappula (به عنوان برون گروه) با استفاده از توالی هسته ای its و توالی کلروپلاستی trnl-f به طور جداگانه و نیز به صورت ترکیبی آنالیز شدند. برای مشخص کردن روند تکامل صفات مورفولوژیکی، شش صفت تشخیصی بر روی درخت ترکیبی با استفاده از برنامه macclade 4 نشان داده شد. آنالیز ها آشکار کرد که بخشه rochelia به دلیل قرار گرفتن بخشه مونوتیپیک cryptocarpa (rochelia c...
full textMy Resources
document type: thesis
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023